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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
18/12/2019 |
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Data da última atualização: |
23/08/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, K. J.; GUIMARÃES, C. T.; GUILHEN, J. H. S.; GUIMARAES, P. E. de O.; PARENTONI, S. N.; TRINDADE, R. dos S.; OLIVEIRA, A. A. de; BERNARDINO, K. da C.; PINTO, M. de O.; DIAS, K. O. das G.; BERNARDES, C. de O.; DIAS, L. A. dos S.; GUIMARAES, L. J. M.; PASTINA, M. M. |
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Afiliação: |
Karla Jorge Silva, Universidade Federal de Viçosa; CLAUDIA TEIXEIRA GUIMARAES, CNPMS; José Henrique Soler Guilhen, Universidade Federal do Espírito Santo; PAULO EVARISTO DE O GUIMARAES, CNPMS; SIDNEY NETTO PARENTONI, CNPMS; ROBERTO DOS SANTOS TRINDADE, CNPMS; Amanda Avelar de Oliveira, Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz"; Karine da Costa Bernardino, Universidade Federal de Viçosa; MARCOS DE OLIVEIRA PINTO, CNPMS; Kaio Olímpio das Graças Dias, Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz"; Carolina de Oliveira Bernardes, Universidade Federal do Espírito Santo; Luiz Antônio dos Santos Dias, Universidade Federal de Viçosa; LAURO JOSE MOREIRA GUIMARAES, CNPMS; MARIA MARTA PASTINA, CNPMS. |
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Título: |
High-density SNP-based genetic diversity and heterotic patterns of tropical maize breeding lines. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Crop Science, v. 60, p. 779-787, 2020 |
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DOI: |
10.1002/csc2.20018 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Understanding the crop diversity is critical for a successful breeding program, helping to dissect the genetic relationship among lines and to identify superior parents. This study aimed to investigate the genetic diversity of maize inbred lines, and to verify the relationship between genetic diversity and heterotic patterns based on hybrid yield performance. A total of 1,041 maize inbred lines were genotyped-by-sequencing, generating 32,840 quality-filtered SNPs. Diversity analyses were performed using the Neighbor-Joining clustering method, which generated diversity groups. The clustering of lines based on the diversity groups was compared to the pre-defined heterotic groups using the additive genomic relationship matrix and UPGMA. Additionally, the genetic diversity of lines was correlated with yield performance of their corresponding 591 single-cross hybrids. The SNP-based genetic diversity analysis was efficient and reliable to assign lines within pre-defined heterotic groups. However, solely these genetic distances among inbred lines were not good predictors of the hybrid performance, once a low but significant Pearson?s correlation (0.22, p-value ? 0.01) was obtained between parental genetic distances and hybrids performance. Thus, SNP-based genetic distances provided important insights for effective parental selection, avoiding crossed between genetically similar tropical maize lines. |
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Thesagro: |
Melhoramento Genético Vegetal; Milho; Variação Genética. |
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Thesaurus Nal: |
Cluster analysis. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
LEADER 02427naa a2200337 a 4500
001 2117164
005 2020-08-23
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245 $aHigh-density SNP-based genetic diversity and heterotic patterns of tropical maize breeding lines.$h[electronic resource]
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520 $aUnderstanding the crop diversity is critical for a successful breeding program, helping to dissect the genetic relationship among lines and to identify superior parents. This study aimed to investigate the genetic diversity of maize inbred lines, and to verify the relationship between genetic diversity and heterotic patterns based on hybrid yield performance. A total of 1,041 maize inbred lines were genotyped-by-sequencing, generating 32,840 quality-filtered SNPs. Diversity analyses were performed using the Neighbor-Joining clustering method, which generated diversity groups. The clustering of lines based on the diversity groups was compared to the pre-defined heterotic groups using the additive genomic relationship matrix and UPGMA. Additionally, the genetic diversity of lines was correlated with yield performance of their corresponding 591 single-cross hybrids. The SNP-based genetic diversity analysis was efficient and reliable to assign lines within pre-defined heterotic groups. However, solely these genetic distances among inbred lines were not good predictors of the hybrid performance, once a low but significant Pearson?s correlation (0.22, p-value ? 0.01) was obtained between parental genetic distances and hybrids performance. Thus, SNP-based genetic distances provided important insights for effective parental selection, avoiding crossed between genetically similar tropical maize lines.
650 $aCluster analysis
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Biblioteca |
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Cutter |
Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 244 | |
| 101. |  | SOARES, M. T. S.; CALHEIROS, D. F.; GALVANI, F.; FEIDEN, A.; CAMPOLIN, A. I.; SILVA, W. T. L. da. Parâmetros físico-químicos e eficiência de fossa séptica biodigestora na redução da carga orgânica de esgoto originado de água doce ou salobra, na Borda Oeste do Pantanal. In: SEMINÁRIO INTERNACIONAL DE AGROECOLOGIA DA AMÉRICA DO SUL, 2.; JORNADA INTERNACIONAL DE EDUCAÇÃO DO CAMPO, 1.; SEMINÁRIO DE AGROECOLOGIA DE MATO GROSSO DO SUL, 6; ENCONTRO DE PRODUTORES AGROECOLÓGICOS DE MATO GROSSO DO SUL, 5.; SEMINÁRIO DE SISTEMAS AGROFLORESTAIS EM BASES AGROECOLÓGICAS DE MATO GROSSO DO SUL, 2., 2016, Dourados. Agroecologia e soberania alimentar: saberes em busca do bem viver: anais. Dourados: UFGD, 2016. Não paginado. Agroecol 2016. 1 CD-ROM. Publicado também em: Cadernos de Agroecologia, v. 11, n. 2, 2016.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 103. | | SOARES, G. B.; MALAGUTTI, A. R.; VAZ, C. M. P.; SILVA, W. T. L. da; RIBEIRO, C. Photocatalytic degradation of diuron in aqueous solution by nano-TiO2 films In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON FOOD AND AGRICULTURE APPLICATIONS OF NANOTECHNOLOGIES - NanoAgri, 2010, São Pedro, SP. [Anais…] São Pedro: Aptor Software, 2010. Editors: Caue Ribeiro, Odílio Benedito Garrido de Assis, Luiz Henrique Capparelli Mattoso, Sérgio Mascarenhas.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 104. | | FIALHO, L. P.; SILVA, W. T. L. da; MILORI, D. M. B. P.; SIMÕES, M. L.; MARTIN-NETO, L. Comparação de métodos para determinação do período de maturação da matéria orgânica durante o processo de compostagem a partir de diferentes resíduos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 31., 2007, Gramado, RS. Conquistas e desafios da ciência do solo brasileira. Anais... Porto Alegre: SBCS, 2007. não paginado. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 107. | | TOLEDO, R. A. de; SIMOES, M. L.; SILVA, W. T. L. da; MARTIN-NETO, L.; VAZ, C. M. P. Determination of metal ions extracted by DTPA in a soil treated with effluent using an Hg-electroplated-Pt microelectrode. International journal of environmental analytical chemistry, New York, v. 89, n. 15, p. 1099-1111, 2009.| Tipo: Metodologia Cientifica |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 110. | | SOARES, M. T. S.; CALHEIROS, D. F.; GALVANI, F.; FEIDEN, A.; CAMPOLIN, A. I.; SILVA, W. T. L. da. Eficiência de fossa séptica biodigestora na redução de parâmetros biológicos em esgoto originado de água doce ou salobra, na borda oeste do Pantanal. In: SEMINÁRIO INTERNACIONAL DE AGROECOLOGIA DA AMÉRICA DO SUL, 2.; JORNADA INTERNACIONAL DE EDUCAÇÃO DO CAMPO, 1.; SEMINÁRIO DE AGROECOLOGIA DE MATO GROSSO DO SUL, 6; ENCONTRO DE PRODUTORES AGROECOLÓGICOS DE MATO GROSSO DO SUL, 5.; SEMINÁRIO DE SISTEMAS AGROFLORESTAIS EM BASES AGROECOLÓGICAS DE MATO GROSSO DO SUL, 2., 2016, Dourados. Agroecologia e soberania alimentar: saberes em busca do bem viver: anais. Dourados: UFGD, 2016. Não paginado. Agroecol 2016. 1 CD-ROM. Publicado também em: Cadernos de Agroecologia, v. 11, n. 2, 2016.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 111. | | PAULA, B. S. de; MILORI, D. M. B. P.; MONTES, C. R.; SILVA, W. T. L. da. Espectroscopia de fluorescência em matriz excitação-emissão aplicada a ácidos húmicos extraídos de horizontes espódicos da floresta amazônica. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE INSTRUMENTAÇÃO AGROPECUÁRIA, 2014, São Carlos, SP Anais do SIAGRO: ciência, inovação e mercado 2014. São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação, 2014. p. 193-196. Editores: Carlos Manoel Pedro Vaz, Débora Marcondes Bastos Pereira Milori, Silvio Crestana.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 113. | | FERRARESI, T. M.; SILVA, W. T. L. da; MARTIN NETO, L.; SILVEIRA, P. M. da; MADARI, B. E. Espectroscopia de infravermelho na determinação da textura do solo. Revista Brasileira de Ciência do Solo, Viçosa, MG, v. 36, n. 6, p. 1769-1777, dez. 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Instrumentação. |
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| 114. | | MARTELLI, L. F. A.; GALINDO, N.; MATTOS, M. M. de; POSADAS, A. LEONEL, L. F.; SILVA, W. T. L. da. Espectroscopia na região do infravermelho próximo (NIRS): uma ferramenta para estimar o teor de carbono em amostras de solo. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 4., 2012, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2012. p. 112. Editores técnicos: João de Mendonça Naime, Lucimara Aparecida Forato, Maria Alice Martins, Ladislau Marcelino Rabello, Rubens Bernardes Filho. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 56)| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 115. | | MELLO, M. A. de; ABREU, P. A. da S.; SILVA, W. T. L. da; BASSOI, L. H. Índice de área foliar do milho irrigado em função da aplicação de biofertilizante e de fertilizantes minerais In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 14., 2022, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2022. Editores técnicos: Cristiane Sanchez Farinas, Daniel Souza Corrêa, Maria Alice Martins, Maria Fernanda Berlingieri Durigan, Paulo Sérgio de Paula Herrmann Júnior. 60| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 116. | | ABREU, P. A. S.; COSTA, B. R. S.; OLDONI, H.; SILVA, W. T. L. da; BASSOI, L. H. Índice de área foliar e produtividade do milho fertirrigado com efluente de esgoto tratado. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE INSTRUMENTAÇÃO AGROPECUÁRIA, 4., 2019, São Carlos, SP. Ciência, inovação e mercado: anais. São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação, 2019. Editores: Paulino Ribeiro Villas-Boas, Maria Alice Martins, Débora Marcondes Bastos Pereira Milori, Ladislau Martin Neto. SIAGRO 2019. 23-27| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 117. | | GARBIN, J. R.; MILORI, D. M. B. P.; SIMOES, M. L.; SILVA, W. T. L. da; MARTIN NETO, L. Influence of humic substances on the photolysis of aqueous pesticide residues. Chemosphere, [S. l.], v. 66, n. 7, p. 1692-1698, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 118. | | SILVA, W. T. L. da; ALMEIDA, L. F. de; SIMOES, M. L.; FORATO, L. A.; MARTIN NETO, L. Implantação de um programa de gerenciamento de resíduos químicos nos laboratórios de pesquisa da Embrapa Instrumentação Agropecuária. In: CONGRESSO BRASILEIRO ICTR: GESTÃO AMBIENTAL E DESENVOLVIMENTO SUSTENTÁVEL; DESAFIO BRASILEIRO, 3., 2006, São Pedro. Livro de resumos... São Paulo: ICTR, 2006. p. 245-247. Organização: Angela M. Magosso Takayanagui, Arlindo Philippi Júnior e Celina Lopes Duarte.| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 119. | | GALINDO, N.; SOARES, M. T. S.; MILORI, D. M. B. P.; MARTIN-NETO, L.; SILVA, W. T. L. da. Humificação da matéria orgânica de solo irrigado com efluente de fossa séptica biodigestora nas condições da borda oeste do pantanal. In: ENCONTRO BRASILEIRO DE SUBSTÂNCIAS HÚMICAS, 9., 2011. Aracaju, Sergipe. Matéria Orgânica Natural e Substâncias Húmicas: dos avanços das técnicas de caracterização do sequestro de C: anais. Aracaju, Sergipe: Departamento de Quimica da UFS: Grupo Brasileiro do IHSS, 2011. Não paginado.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação; Embrapa Pantanal. |
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